Differentiation of Mycobacterium tuberculosis clinical strains using restrikction fragment length polymorphism technique based on hsp65 gene

Khosravi, A. and Hashemi Shahraki, A. (2005) Differentiation of Mycobacterium tuberculosis clinical strains using restrikction fragment length polymorphism technique based on hsp65 gene. Journal of Shahrekord Uuniversity of Medical Sciences, 7.

[img]
Preview
Text
18.pdf

Download (1MB) | Preview
Official URL: http://journal.skums.ac.ir/article-1-45-fa.html

Abstract

زمینه و هدف: در سالهای اخیر، به کارگیری تکنیک PCR (Polymerase Chain Reaction) و به دنبال آن آنالیز محصولPCR توسط آنزیمهای محدودالاثر (Restriction Fragment Length Polymorphism=RFLP) برای افتراق مایکوباکتریومها تا سطح گونه، استفاده شده است. در حالی که جزئیات افتراقی گونههای غیرتوبرکلوزی مایکوباکتریومها توسط این تکنیک مشخص شده و حتی در تعدادی از آنها این روش برای پیگیری مولکولار اپیدمیولوژی اثبات شده است، تنها تعداد کمی از سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد بررسی قرار گرفتهاند. مطالعه حاضر این متد افتراقی را برای سویههای جدا شده در مقیاس وسیعتر با هدف تعیین پلی مورفیسم احتمالی مورد ارزیابی قرار داد. روش بررسی: یکصد و پنجاه سویه کلینیکی از بیماران مراجعهکننده به مرکز سل اهواز جمعآوری شد. رنگآمیزی اسیدفست برای سویهها انجام گرفت، سپس سویهها به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس توسط خصوصیات کشت و تستهای بیوشیمیایی دستهبندی شدند. تکنیک PCR-RFLP با استفاده از DNA ژنومی استخراج شده به دنبال PCR بر مبنای تکثیر قطعه bp439 از ژن hsp65 توسط پرایمرهای اختصاصی جنس مورد استفاده قرار گرفت. بعد از هضم محصولات PCR توسط آنزیمهای BstEII و HaeIII آنالیز آنزیمی انجام گرفت. یافته ها: بر اساس نتایج بدست آمده، 145 سویه کلینیکی (6/96) الگوهای یکسان شبیه به سویههای استاندارد مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، برای HaeIII فراگمنتهایی به طول 72/140/165 و برای BstEII به طول 82/120/250، نشان دادند. سه الگوی متفاوت در پنج سویه کلینیکی در الگوهای بدست آمده از هضم HaeIII با فراگمنتهایی به طول 145/165 (سه سویه)، 80/100/180 (یک سویه) و 72/194 (یک سویه) مشاهده شد در حالی که الگوی بدست آمده از هضم BstEII این سویهها تنوع نداشت و شبیه به دیگر سویهها بود. نتیجهگیری: نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که در موارد نادر، پلیمورفیسمهایی در توالی ژن hsp65 سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ممکن است وجود داشته باشد.

Item Type: Article
Uncontrolled Keywords: hsp65, Mycobacterium tuberculosis, Molecular diagnosis, Restriction enzymes.
Subjects: QU Biochemistry > Cell biology and genetics
QW Microbiology and Immunology
Divisions: Reserach Vice-Chancellar Department > Journal of Shahrekord University of Medical Sciences
Depositing User: zahra bagheri .
Date Deposited: 03 Sep 2017 06:38
Last Modified: 03 Sep 2017 06:38
URI: http://eprints.skums.ac.ir/id/eprint/4270

Actions (login required)

View Item View Item